特色業務包括：
一、門診業務:
(一)一般臨床感染症(例如：肺炎、泌尿道感染、腹腔內感染、腦膜炎、感染性腹瀉、不明熱…)。
(二)愛滋病診療:本院為衛生福利部疾病管制署核可之愛滋病指定醫院，提供雞尾酒療法，經治療後病毒量減少且免疫力恢復，使病人可恢復過正常的生活、工作、就學。愛滋病傳播能力與患者之病毒量有關，疾病傳播通常藉由不安全性行為、靜脈毒癮、母子垂直傳染。愛滋病病 人免疫力會降低，得到伺機性感染。
(三)免費匿名、隱私、安心之『愛滋病與梅毒』篩檢及諮詢服務(15-20分即可知道篩檢報告)。
(四) 免費暴露愛滋病毒「前」預防性投藥服務(PreP)。
(五) 暴露愛滋病毒「後」預防性投藥服務。
二、住院診療:
診治疾病如(例如：腦膜炎、肺炎、泌尿道感染…)、愛滋病併發症、結核病等。
三、感管業務(主要目的在為病患營造安全之就醫環境):
(一)抗生素管理：積極推動抗生素管理計畫，藉由抗生素會診及審核，減少不合理之藥物使用，以避免抗藥菌株快速產生。
(二)感染預防與管制: 分析各單位之感染率(包括血流相關感染、呼吸器相關感染、導尿管相關感染等)重要議題。統計各分離菌株及其抗藥性，並加以趨勢分析，並分析可能原因，並提出應對解決方案，本科依據文獻証據，執行感染預防與管制計畫，包括人員教育、隔離防護措施、手部衛生、組合式照護、環境清潔等。
(三)防疫工作：早期診斷法定傳染病，做好隔離防護措施，配合疾病管制署防疫系統密切追蹤病人， 以阻止疾病散播。並配合政府政策定期作相關宣導(如新冠病毒、流行性感冒、登革熱、腸病毒…等常見季節性疾病)。