為保障民眾用藥安全，鑑於現有公費COVID-19治療用治療口服抗病毒藥物Paxlovid與多項藥物會有交互作用，健保醫療資訊雲端查詢系統(簡稱「健保雲端系統」)已新增交互作用主動提示功能，提醒各醫事人員多加留意。
Paxlovid是身體中一種酶(CYP3A)的抑制劑，可能會增加經由這種酶代謝的藥物的血漿濃度，依照用藥說明書載明，該藥與10大類藥物具禁忌(附表1)，並與35類藥物會產生交互作用(附表2)，這些藥物包括多種心臟血管用藥、止痛藥、抗癌藥、抗凝血藥、抗痙攣藥、抗憂鬱或精神病劑、抗痛風藥、HIV與C型肝炎等抗病毒劑、抗感染劑、荷爾蒙避孕藥、免疫抑制劑、麻醉、鎮靜/安眠藥，以及全身性類固醇等藥品，使用時須注意藥物血中濃度。
健保署除透過與各特約醫事服務機構專屬健保資訊網(VPN)公告區及「健保雲端系統」摘要區提示Paxlovid的用藥資訊外，也依用藥說明書於雲端系統透過應用程式介面(API)建置藥品交互作用主動提示功能，提醒醫師善用雲端查詢機制，於開立處方時，密切注意並詢問病患是否有使用具禁忌或有交互作用之藥物。
輝瑞Paxlovid中文說明書 (1110908版)
默沙東Molnupiravir中文說明書 (1110504版)